一、物理方法
　　根據(jù)水體及水體中污染物的理化性質，采用機械方法凈化水質，如過濾、沉淀等，這些方法原理簡單，應用普遍，許多養(yǎng)殖戶自覺或無意識中已經(jīng)使用。
　　1、沉淀　水中懸浮物質過多可使水體混濁度和粘滯性增大，影響水產(chǎn)動物特別是其幼體階段的正常生長發(fā)育，故養(yǎng)殖用水必須行沉淀處理。養(yǎng)殖戶應根據(jù)自身情況配備沉淀池。
　　2、換水  換水操作簡單、效果較好，在生產(chǎn)實踐中廣泛應用。但采用換水方法調控水質不符合當今節(jié)約水資源的要求，并且目前養(yǎng)殖生產(chǎn)中換出的水常常不經(jīng)處理就直接排放到外界環(huán)境中，加劇了環(huán)境污染，不予提倡，而且直接加換外界水，必須對外界水質進行分析、了解。
　　3、曝氣  主要為增加水中溶氧量，清除水中有害氣體，以達到改善水質的目的，常用手段是使用增氧機,增氧機能使池塘水體上下水層對流，增加水中溶氧量，使水中有毒氣體氧化或溢出，打破水體分層，起到改善水質的作用,建議晴天中午開機1-2小時。
　　4、吸附  使用多孔固相物質（如活性炭、硅膠、沸石等）作為吸附劑來達到凈水目的。
　　5、過濾  物理過濾法主要用以清除水中懸浮物及大型水生生物等。生產(chǎn)上往往利用篩網(wǎng)對水進行過濾，網(wǎng)目大小根據(jù)需要而定，還有砂濾、膜過濾，纖維過濾等等。
　　6、泡沫分離  向水中通氣，水中的表面活性物質被微小的氣泡吸附，浮于水面形成泡沫，通過收集并清除泡沫達到水質凈化的目的。
　　7、紫外線照射  利用紫外線（波長200~400nm）對養(yǎng)殖用水進行消毒，殺滅水中臻病微生物。
　　8、磁分離法  利用電磁原理對水體中的重金屬離子等污染物進行電磁分離，是較新穎的水處理方法，目前尚未普及應用。

一體化污水處理設備圖（1）

　　二、化學方法
　　利用化學反應來處理水中污染物或懸浮膠粒。

　　1、凝絮  使用一些化學試劑，使水中微小顆粒及膠體凝聚成較大絮凝體，加速沉淀，凈化水質。通常凝絮劑對海水的處理效果較差。常用凝絮劑有以下幾種。
　　（1）鋁鹽  常用種類有硫酸鋁、堿式氯化鋁等。
　?。?）明礬  明礬中的鋁離子具有很強的凝結能力，對于降低水的混濁度，在水產(chǎn)養(yǎng)殖特別是池塘養(yǎng)殖用水的凈化處理中應用普遍。
　　（3）鐵鹽  常用種類有氯化鐵和硫酸鐵，但它們不如鋁鹽類凝絮劑應用廣泛。
　?。?）農(nóng)用石膏  主要成分為硫酸鈣，可增加鈣硬度，致使產(chǎn)生碳酸鈣沉淀，對降低混濁度有一定效果。
　　（5）有機高分子凝絮劑  這類凝絮劑國外使用得較多，主要為縮合烯酰胺類有機化合物。
　　2、中和  改變水體過高或過低的pH值。常用生石灰等調節(jié)水體的pH值，使水呈中性或弱堿性，還能增加水中的鈣含量，改良底質，殺滅病原體。新砌水泥池往往水中pH值過高，不利于水產(chǎn)動物生長，常用草酸、醋酸等弱酸中和處理。
　　3、EDTA-Na2，可清除水體中含量過高的重金屬離子。對于一些對重金屬敏感的魚、蝦、貝等，其苗種培育用水必須經(jīng)EDTA-Na2預處理后方可使用。

一體化污水處理設備圖（2）

　　4、化學消毒  應用化學消毒劑與水中有毒物質發(fā)生氧化還原反應，降低或消除其毒性，殺滅有害微生物。
　　（1）鹵素制劑  主要是含氯類消毒劑，其實質是產(chǎn)生次氯酸和次氯酸根離子，與水中有害物質發(fā)生氧化還原反應。常用種類有二氧化氯、漂白粉、二氯異氰尿酸鈉等，還有二溴海因、碘制劑等。
　?。?）臭氧  它能破壞和分解細菌的細胞膜，迅速擴散透入細胞內部，氧化破壞或分解細胞內酶而迅速使病原菌致死。目前也有專門用于水產(chǎn)養(yǎng)殖的便攜式臭氧發(fā)生器，較為經(jīng)濟適用。
　?。?）是一種強氧化劑，在酸性、中性及堿性水環(huán)境中均有的氧化性，生產(chǎn)上不僅可用作殺菌消毒劑，也是一種良好的脫色除臭劑，但其質量分數(shù)太高也會對水產(chǎn)動物產(chǎn)生毒害作用，因此使用時須控制劑量。
　　（4）*  又稱雙氧水，為無色、無臭、透明的液體，其氧化性較強，能夠迅速破壞微生物及原生動物的蛋白質活性而起到滅活作用，已在蝦病防治等方面取得了較好的效果。
　　（5）其他化學消毒劑如季胺鹽等。

　　同化為菌體成分，這種菌膠團稱作活性污泥。
　　5、水生植物  水生植物能夠通過光合作用，有效吸收利用水中的二氧化碳等物質，起到水質凈化的作用。常用的水生植物有藻類、水葫蘆、水花生、鳳眼蓮、大米草等。